Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR47O94967 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR47O94967 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR47O94967 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR47O94967 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR47O94967 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR47O94967 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR47O94967 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR47O94967 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR47O94967 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR47O94967 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR47O94967 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR47O94967 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR47O94967 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR47O94967 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR47O94967 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR47O94967 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR47O94967 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR47O94967 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR47O94967 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR47O94967 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR47O94967 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR47O94967 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR47O94967 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR47O94967 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR47O94967 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR47O94967 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR47O94967 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR47O94967 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR47O94967 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR47O94967 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR47O94967 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR47O94967 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR47O94967 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR47O94967 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR47O94967 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms