Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT38O76015 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT38O76015 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT38O76015 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT38O76015 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT38O76015 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT38O76015 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT38O76015 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT38O76015 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT38O76015 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT38O76015 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT38O76015 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT38O76015 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT38O76015 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT38O76015 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT38O76015 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT38O76015 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT38O76015 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT38O76015 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT38O76015 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT38O76015 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT38O76015 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT38O76015 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT38O76015 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT38O76015 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT38O76015 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT38O76015 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT38O76015 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT38O76015 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT38O76015 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT38O76015 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT38O76015 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT38O76015 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT38O76015 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT38O76015 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT38O76015 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT38O76015 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT38O76015 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT38O76015 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT38O76015 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT38O76015 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT38O76015 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT38O76015 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT38O76015 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT38O76015 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT38O76015 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT38O76015 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT38O76015 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT38O76015 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT38O76015 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT38O76015 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT38O76015 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT38O76015 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT38O76015 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT38O76015 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT38O76015 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT38O76015 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT38O76015 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms