Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN11O75508 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN11O75508 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN11O75508 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms