Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK1O75385 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK1O75385 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ULK1O75385 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ULK1O75385 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ULK1O75385 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ULK1O75385 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK1O75385 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK1O75385 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK1O75385 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK1O75385 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK1O75385 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ULK1O75385 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK1O75385 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK1O75385 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK1O75385 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ULK1O75385 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK1O75385 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ULK1O75385 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ULK1O75385 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ULK1O75385 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ULK1O75385 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ULK1O75385 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK1O75385 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK1O75385 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK1O75385 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK1O75385 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK1O75385 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ULK1O75385 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ULK1O75385 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ULK1O75385 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms