Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF40O75150 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF40O75150 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF40O75150 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF40O75150 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF40O75150 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF40O75150 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF40O75150 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF40O75150 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF40O75150 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF40O75150 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF40O75150 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF40O75150 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF40O75150 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF40O75150 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF40O75150 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF40O75150 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF40O75150 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF40O75150 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF40O75150 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF40O75150 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF40O75150 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF40O75150 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF40O75150 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF40O75150 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF40O75150 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF40O75150 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF40O75150 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF40O75150 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF40O75150 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF40O75150 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF40O75150 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF40O75150 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF40O75150 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF40O75150 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF40O75150 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF40O75150 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF40O75150 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF40O75150 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF40O75150 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF40O75150 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF40O75150 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF40O75150 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF40O75150 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF40O75150 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF40O75150 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF40O75150 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF40O75150 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF40O75150 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF40O75150 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF40O75150 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF40O75150 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF40O75150 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF40O75150 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF40O75150 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF40O75150 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF40O75150 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF40O75150 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF40O75150 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF40O75150 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF40O75150 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF40O75150 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF40O75150 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF40O75150 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF40O75150 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF40O75150 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF40O75150 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF40O75150 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF40O75150 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF40O75150 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF40O75150 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF40O75150 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF40O75150 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF40O75150 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF40O75150 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms