Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KERAO60938 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KERAO60938 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KERAO60938 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KERAO60938 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KERAO60938 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KERAO60938 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KERAO60938 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KERAO60938 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KERAO60938 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KERAO60938 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KERAO60938 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KERAO60938 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KERAO60938 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KERAO60938 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KERAO60938 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KERAO60938 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KERAO60938 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KERAO60938 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KERAO60938 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KERAO60938 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KERAO60938 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KERAO60938 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KERAO60938 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KERAO60938 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KERAO60938 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KERAO60938 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KERAO60938 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KERAO60938 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KERAO60938 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KERAO60938 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KERAO60938 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KERAO60938 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KERAO60938 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KERAO60938 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KERAO60938 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KERAO60938 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KERAO60938 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KERAO60938 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KERAO60938 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KERAO60938 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KERAO60938 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KERAO60938 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KERAO60938 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KERAO60938 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KERAO60938 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms