Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF4O60810 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF4O60810 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms