Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL41O60662 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL41O60662 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms