Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFDO43915 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VEGFDO43915 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms