Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN6O43657 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSPAN6O43657 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN6O43657 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms