Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L2O43491 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
EPB41L2O43491 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L2O43491 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms