Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COCHO43405 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COCHO43405 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COCHO43405 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COCHO43405 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COCHO43405 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COCHO43405 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COCHO43405 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COCHO43405 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COCHO43405 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COCHO43405 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COCHO43405 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COCHO43405 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COCHO43405 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COCHO43405 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COCHO43405 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COCHO43405 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COCHO43405 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COCHO43405 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COCHO43405 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COCHO43405 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COCHO43405 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COCHO43405 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COCHO43405 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COCHO43405 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COCHO43405 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COCHO43405 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COCHO43405 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COCHO43405 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COCHO43405 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COCHO43405 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COCHO43405 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COCHO43405 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COCHO43405 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COCHO43405 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COCHO43405 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COCHO43405 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COCHO43405 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COCHO43405 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COCHO43405 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COCHO43405 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COCHO43405 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COCHO43405 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COCHO43405 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COCHO43405 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COCHO43405 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COCHO43405 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COCHO43405 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COCHO43405 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COCHO43405 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COCHO43405 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COCHO43405 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COCHO43405 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COCHO43405 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COCHO43405 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COCHO43405 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COCHO43405 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COCHO43405 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms