Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SGSM2O43147 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SGSM2O43147 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms