Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEFVO15553 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEFVO15553 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEFVO15553 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEFVO15553 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEFVO15553 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEFVO15553 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEFVO15553 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEFVO15553 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEFVO15553 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MEFVO15553 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEFVO15553 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEFVO15553 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MEFVO15553 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MEFVO15553 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEFVO15553 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEFVO15553 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MEFVO15553 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MEFVO15553 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEFVO15553 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MEFVO15553 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEFVO15553 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MEFVO15553 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEFVO15553 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEFVO15553 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEFVO15553 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEFVO15553 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEFVO15553 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEFVO15553 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEFVO15553 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEFVO15553 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEFVO15553 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEFVO15553 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEFVO15553 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEFVO15553 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEFVO15553 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEFVO15553 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEFVO15553 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEFVO15553 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEFVO15553 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEFVO15553 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEFVO15553 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MEFVO15553 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEFVO15553 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEFVO15553 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEFVO15553 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MEFVO15553 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MEFVO15553 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEFVO15553 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEFVO15553 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEFVO15553 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEFVO15553 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEFVO15553 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEFVO15553 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEFVO15553 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEFVO15553 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MEFVO15553 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEFVO15553 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEFVO15553 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEFVO15553 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEFVO15553 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEFVO15553 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEFVO15553 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEFVO15553 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms