Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VILLO15195 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VILLO15195 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VILLO15195 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VILLO15195 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VILLO15195 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VILLO15195 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VILLO15195 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VILLO15195 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VILLO15195 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VILLO15195 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VILLO15195 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VILLO15195 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VILLO15195 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VILLO15195 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VILLO15195 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VILLO15195 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VILLO15195 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VILLO15195 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VILLO15195 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VILLO15195 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VILLO15195 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VILLO15195 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VILLO15195 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VILLO15195 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VILLO15195 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VILLO15195 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VILLO15195 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VILLO15195 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VILLO15195 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VILLO15195 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VILLO15195 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VILLO15195 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VILLO15195 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VILLO15195 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VILLO15195 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VILLO15195 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VILLO15195 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VILLO15195 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VILLO15195 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VILLO15195 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VILLO15195 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VILLO15195 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VILLO15195 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VILLO15195 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VILLO15195 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms