Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR1CO15160 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR1CO15160 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms