Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAMP2O15127 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAMP2O15127 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms