Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA3O00505 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA3O00505 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms