Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NFKBIEO00221 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NFKBIEO00221 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NFKBIEO00221 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIEO00221 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms