Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SNAP23O00161 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNAP23O00161 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms