Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KTA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KTA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KTA2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KTA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KTA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
J3KTA2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KTA2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KTA2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KTA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KTA2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
J3KTA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
J3KTA2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KTA2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KTA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
J3KTA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KTA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KTA2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KTA2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
J3KTA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KTA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KTA2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KTA2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
J3KTA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KTA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KTA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KTA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KTA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KTA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KTA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
J3KTA2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
J3KTA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KTA2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KTA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KTA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KTA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KTA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
J3KTA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
J3KTA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KTA2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KTA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KTA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KTA2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KTA2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
J3KTA2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3KTA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3KTA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
J3KTA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KTA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KTA2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
J3KTA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
J3KTA2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms