Protein–RNA interactions for Protein: C9JTQ0

ANKRD63, Ankyrin repeat domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD63C9JTQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD63C9JTQ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD63C9JTQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD63C9JTQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms