Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PALM2-AKAP2B1ALY0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms