Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF839A8K0R7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF839A8K0R7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms