Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
C4orf47A7E2U8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C4orf47A7E2U8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C4orf47A7E2U8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms