Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
YJEFN3A6XGL0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
YJEFN3A6XGL0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
YJEFN3A6XGL0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms