Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 418.8 ms