Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49BA6NDI0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49BA6NDI0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM49BA6NDI0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms