Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC66A2RUB6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC66A2RUB6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC66A2RUB6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms