Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SF12

CCDC163, Coiled-coil domain-containing 163, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC163A0A0D9SF12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC163A0A0D9SF12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC163A0A0D9SF12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC163A0A0D9SF12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms