Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WUJ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WUJ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WUJ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WUJ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WUJ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WUJ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WUJ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A087WUJ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A0A087WUJ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A0A087WUJ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms