Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SERP1Q9Y6X1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SERP1Q9Y6X1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SERP1Q9Y6X1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SERP1Q9Y6X1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SERP1Q9Y6X1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SERP1Q9Y6X1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SERP1Q9Y6X1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SERP1Q9Y6X1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERP1Q9Y6X1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SERP1Q9Y6X1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERP1Q9Y6X1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SERP1Q9Y6X1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERP1Q9Y6X1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERP1Q9Y6X1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERP1Q9Y6X1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERP1Q9Y6X1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SERP1Q9Y6X1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERP1Q9Y6X1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SERP1Q9Y6X1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SERP1Q9Y6X1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERP1Q9Y6X1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERP1Q9Y6X1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERP1Q9Y6X1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SERP1Q9Y6X1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERP1Q9Y6X1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SERP1Q9Y6X1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SERP1Q9Y6X1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERP1Q9Y6X1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SERP1Q9Y6X1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERP1Q9Y6X1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERP1Q9Y6X1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SERP1Q9Y6X1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SERP1Q9Y6X1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERP1Q9Y6X1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SERP1Q9Y6X1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERP1Q9Y6X1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SERP1Q9Y6X1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SERP1Q9Y6X1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERP1Q9Y6X1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SERP1Q9Y6X1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms