Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y698

CACNG2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG2Q9Y698 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG2Q9Y698 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG2Q9Y698 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG2Q9Y698 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG2Q9Y698 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG2Q9Y698 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG2Q9Y698 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNG2Q9Y698 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG2Q9Y698 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG2Q9Y698 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG2Q9Y698 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG2Q9Y698 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG2Q9Y698 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG2Q9Y698 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG2Q9Y698 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG2Q9Y698 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG2Q9Y698 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNG2Q9Y698 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG2Q9Y698 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNG2Q9Y698 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNG2Q9Y698 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNG2Q9Y698 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG2Q9Y698 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNG2Q9Y698 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNG2Q9Y698 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNG2Q9Y698 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNG2Q9Y698 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG2Q9Y698 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG2Q9Y698 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNG2Q9Y698 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG2Q9Y698 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG2Q9Y698 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG2Q9Y698 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG2Q9Y698 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG2Q9Y698 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG2Q9Y698 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG2Q9Y698 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNG2Q9Y698 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNG2Q9Y698 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNG2Q9Y698 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG2Q9Y698 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG2Q9Y698 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG2Q9Y698 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG2Q9Y698 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG2Q9Y698 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG2Q9Y698 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG2Q9Y698 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG2Q9Y698 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACNG2Q9Y698 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms