Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
GTF3C3Q9Y5Q9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GTF3C3Q9Y5Q9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
GTF3C3Q9Y5Q9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
GTF3C3Q9Y5Q9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
GTF3C3Q9Y5Q9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GTF3C3Q9Y5Q9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GTF3C3Q9Y5Q9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
GTF3C3Q9Y5Q9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GTF3C3Q9Y5Q9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GTF3C3Q9Y5Q9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
GTF3C3Q9Y5Q9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GTF3C3Q9Y5Q9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
GTF3C3Q9Y5Q9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
GTF3C3Q9Y5Q9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
GTF3C3Q9Y5Q9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GTF3C3Q9Y5Q9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
GTF3C3Q9Y5Q9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
GTF3C3Q9Y5Q9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
GTF3C3Q9Y5Q9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
GTF3C3Q9Y5Q9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
GTF3C3Q9Y5Q9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
GTF3C3Q9Y5Q9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
GTF3C3Q9Y5Q9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GTF3C3Q9Y5Q9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
GTF3C3Q9Y5Q9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GTF3C3Q9Y5Q9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
GTF3C3Q9Y5Q9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GTF3C3Q9Y5Q9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
GTF3C3Q9Y5Q9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GTF3C3Q9Y5Q9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GTF3C3Q9Y5Q9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
GTF3C3Q9Y5Q9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GTF3C3Q9Y5Q9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
GTF3C3Q9Y5Q9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GTF3C3Q9Y5Q9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
GTF3C3Q9Y5Q9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GTF3C3Q9Y5Q9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GTF3C3Q9Y5Q9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
GTF3C3Q9Y5Q9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
GTF3C3Q9Y5Q9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GTF3C3Q9Y5Q9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GTF3C3Q9Y5Q9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
GTF3C3Q9Y5Q9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
GTF3C3Q9Y5Q9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms