Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCDHB15Q9Y5E8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCDHB15Q9Y5E8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCDHB15Q9Y5E8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCDHB15Q9Y5E8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCDHB15Q9Y5E8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCDHB15Q9Y5E8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCDHB15Q9Y5E8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCDHB15Q9Y5E8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCDHB15Q9Y5E8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCDHB15Q9Y5E8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCDHB15Q9Y5E8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCDHB15Q9Y5E8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PCDHB15Q9Y5E8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PCDHB15Q9Y5E8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PCDHB15Q9Y5E8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PCDHB15Q9Y5E8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCDHB15Q9Y5E8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PCDHB15Q9Y5E8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PCDHB15Q9Y5E8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PCDHB15Q9Y5E8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PCDHB15Q9Y5E8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PCDHB15Q9Y5E8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PCDHB15Q9Y5E8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PCDHB15Q9Y5E8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCDHB15Q9Y5E8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PCDHB15Q9Y5E8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PCDHB15Q9Y5E8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PCDHB15Q9Y5E8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCDHB15Q9Y5E8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCDHB15Q9Y5E8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PCDHB15Q9Y5E8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCDHB15Q9Y5E8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PCDHB15Q9Y5E8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PCDHB15Q9Y5E8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PCDHB15Q9Y5E8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCDHB15Q9Y5E8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCDHB15Q9Y5E8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PCDHB15Q9Y5E8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PCDHB15Q9Y5E8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PCDHB15Q9Y5E8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PCDHB15Q9Y5E8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PCDHB15Q9Y5E8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PCDHB15Q9Y5E8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PCDHB15Q9Y5E8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCDHB15Q9Y5E8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PCDHB15Q9Y5E8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDHB15Q9Y5E8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDHB15Q9Y5E8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDHB15Q9Y5E8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDHB15Q9Y5E8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PCDHB15Q9Y5E8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PCDHB15Q9Y5E8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PCDHB15Q9Y5E8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PCDHB15Q9Y5E8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PCDHB15Q9Y5E8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PCDHB15Q9Y5E8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PCDHB15Q9Y5E8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCDHB15Q9Y5E8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PCDHB15Q9Y5E8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PCDHB15Q9Y5E8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PCDHB15Q9Y5E8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PCDHB15Q9Y5E8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PCDHB15Q9Y5E8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PCDHB15Q9Y5E8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCDHB15Q9Y5E8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCDHB15Q9Y5E8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PCDHB15Q9Y5E8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCDHB15Q9Y5E8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCDHB15Q9Y5E8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PCDHB15Q9Y5E8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCDHB15Q9Y5E8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms