Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NOP58Q9Y2X3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NOP58Q9Y2X3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NOP58Q9Y2X3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NOP58Q9Y2X3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NOP58Q9Y2X3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NOP58Q9Y2X3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NOP58Q9Y2X3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NOP58Q9Y2X3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NOP58Q9Y2X3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
NOP58Q9Y2X3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NOP58Q9Y2X3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NOP58Q9Y2X3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NOP58Q9Y2X3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NOP58Q9Y2X3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NOP58Q9Y2X3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NOP58Q9Y2X3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NOP58Q9Y2X3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NOP58Q9Y2X3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NOP58Q9Y2X3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NOP58Q9Y2X3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NOP58Q9Y2X3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NOP58Q9Y2X3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NOP58Q9Y2X3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NOP58Q9Y2X3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NOP58Q9Y2X3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NOP58Q9Y2X3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NOP58Q9Y2X3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NOP58Q9Y2X3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NOP58Q9Y2X3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NOP58Q9Y2X3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.38
NOP58Q9Y2X3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NOP58Q9Y2X3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NOP58Q9Y2X3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NOP58Q9Y2X3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NOP58Q9Y2X3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NOP58Q9Y2X3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NOP58Q9Y2X3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NOP58Q9Y2X3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NOP58Q9Y2X3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NOP58Q9Y2X3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NOP58Q9Y2X3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NOP58Q9Y2X3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NOP58Q9Y2X3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NOP58Q9Y2X3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NOP58Q9Y2X3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NOP58Q9Y2X3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NOP58Q9Y2X3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NOP58Q9Y2X3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NOP58Q9Y2X3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NOP58Q9Y2X3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NOP58Q9Y2X3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NOP58Q9Y2X3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NOP58Q9Y2X3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NOP58Q9Y2X3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NOP58Q9Y2X3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NOP58Q9Y2X3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NOP58Q9Y2X3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NOP58Q9Y2X3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NOP58Q9Y2X3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NOP58Q9Y2X3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NOP58Q9Y2X3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NOP58Q9Y2X3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NOP58Q9Y2X3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
NOP58Q9Y2X3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NOP58Q9Y2X3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NOP58Q9Y2X3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NOP58Q9Y2X3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NOP58Q9Y2X3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NOP58Q9Y2X3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NOP58Q9Y2X3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NOP58Q9Y2X3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms