Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FARSAQ9Y285 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FARSAQ9Y285 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FARSAQ9Y285 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FARSAQ9Y285 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FARSAQ9Y285 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARSAQ9Y285 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARSAQ9Y285 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARSAQ9Y285 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARSAQ9Y285 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARSAQ9Y285 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARSAQ9Y285 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FARSAQ9Y285 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARSAQ9Y285 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FARSAQ9Y285 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARSAQ9Y285 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARSAQ9Y285 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FARSAQ9Y285 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FARSAQ9Y285 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FARSAQ9Y285 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FARSAQ9Y285 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FARSAQ9Y285 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FARSAQ9Y285 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FARSAQ9Y285 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FARSAQ9Y285 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FARSAQ9Y285 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FARSAQ9Y285 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FARSAQ9Y285 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FARSAQ9Y285 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FARSAQ9Y285 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FARSAQ9Y285 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FARSAQ9Y285 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FARSAQ9Y285 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FARSAQ9Y285 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FARSAQ9Y285 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FARSAQ9Y285 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FARSAQ9Y285 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FARSAQ9Y285 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FARSAQ9Y285 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FARSAQ9Y285 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARSAQ9Y285 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FARSAQ9Y285 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FARSAQ9Y285 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FARSAQ9Y285 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FARSAQ9Y285 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FARSAQ9Y285 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FARSAQ9Y285 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FARSAQ9Y285 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FARSAQ9Y285 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FARSAQ9Y285 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FARSAQ9Y285 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FARSAQ9Y285 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FARSAQ9Y285 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FARSAQ9Y285 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FARSAQ9Y285 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARSAQ9Y285 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FARSAQ9Y285 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FARSAQ9Y285 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FARSAQ9Y285 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FARSAQ9Y285 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FARSAQ9Y285 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FARSAQ9Y285 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FARSAQ9Y285 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FARSAQ9Y285 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FARSAQ9Y285 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARSAQ9Y285 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FARSAQ9Y285 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FARSAQ9Y285 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FARSAQ9Y285 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms