Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HPS5Q9UPZ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HPS5Q9UPZ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HPS5Q9UPZ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HPS5Q9UPZ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HPS5Q9UPZ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HPS5Q9UPZ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HPS5Q9UPZ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HPS5Q9UPZ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HPS5Q9UPZ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HPS5Q9UPZ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
HPS5Q9UPZ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
HPS5Q9UPZ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
HPS5Q9UPZ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HPS5Q9UPZ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HPS5Q9UPZ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HPS5Q9UPZ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HPS5Q9UPZ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HPS5Q9UPZ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HPS5Q9UPZ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HPS5Q9UPZ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HPS5Q9UPZ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
HPS5Q9UPZ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HPS5Q9UPZ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HPS5Q9UPZ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HPS5Q9UPZ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HPS5Q9UPZ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HPS5Q9UPZ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HPS5Q9UPZ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HPS5Q9UPZ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
HPS5Q9UPZ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HPS5Q9UPZ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HPS5Q9UPZ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HPS5Q9UPZ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HPS5Q9UPZ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
HPS5Q9UPZ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
HPS5Q9UPZ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HPS5Q9UPZ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HPS5Q9UPZ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HPS5Q9UPZ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HPS5Q9UPZ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HPS5Q9UPZ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HPS5Q9UPZ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HPS5Q9UPZ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
HPS5Q9UPZ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HPS5Q9UPZ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HPS5Q9UPZ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HPS5Q9UPZ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HPS5Q9UPZ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HPS5Q9UPZ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HPS5Q9UPZ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
HPS5Q9UPZ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HPS5Q9UPZ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HPS5Q9UPZ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HPS5Q9UPZ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HPS5Q9UPZ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HPS5Q9UPZ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HPS5Q9UPZ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HPS5Q9UPZ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HPS5Q9UPZ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HPS5Q9UPZ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HPS5Q9UPZ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HPS5Q9UPZ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
HPS5Q9UPZ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HPS5Q9UPZ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HPS5Q9UPZ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HPS5Q9UPZ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HPS5Q9UPZ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HPS5Q9UPZ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HPS5Q9UPZ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HPS5Q9UPZ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HPS5Q9UPZ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HPS5Q9UPZ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HPS5Q9UPZ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HPS5Q9UPZ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HPS5Q9UPZ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HPS5Q9UPZ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HPS5Q9UPZ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HPS5Q9UPZ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HPS5Q9UPZ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HPS5Q9UPZ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
HPS5Q9UPZ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HPS5Q9UPZ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HPS5Q9UPZ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HPS5Q9UPZ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
HPS5Q9UPZ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
HPS5Q9UPZ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms