Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
FZD1Q9UP38 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FZD1Q9UP38 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FZD1Q9UP38 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FZD1Q9UP38 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FZD1Q9UP38 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FZD1Q9UP38 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FZD1Q9UP38 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FZD1Q9UP38 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FZD1Q9UP38 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FZD1Q9UP38 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FZD1Q9UP38 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FZD1Q9UP38 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FZD1Q9UP38 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FZD1Q9UP38 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FZD1Q9UP38 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FZD1Q9UP38 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FZD1Q9UP38 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FZD1Q9UP38 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
FZD1Q9UP38 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FZD1Q9UP38 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FZD1Q9UP38 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FZD1Q9UP38 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FZD1Q9UP38 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FZD1Q9UP38 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FZD1Q9UP38 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
FZD1Q9UP38 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FZD1Q9UP38 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FZD1Q9UP38 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
FZD1Q9UP38 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FZD1Q9UP38 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
FZD1Q9UP38 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FZD1Q9UP38 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FZD1Q9UP38 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FZD1Q9UP38 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FZD1Q9UP38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FZD1Q9UP38 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FZD1Q9UP38 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
FZD1Q9UP38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FZD1Q9UP38 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FZD1Q9UP38 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FZD1Q9UP38 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FZD1Q9UP38 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FZD1Q9UP38 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FZD1Q9UP38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FZD1Q9UP38 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FZD1Q9UP38 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FZD1Q9UP38 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FZD1Q9UP38 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FZD1Q9UP38 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FZD1Q9UP38 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
FZD1Q9UP38 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FZD1Q9UP38 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
FZD1Q9UP38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FZD1Q9UP38 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FZD1Q9UP38 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FZD1Q9UP38 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FZD1Q9UP38 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FZD1Q9UP38 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FZD1Q9UP38 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FZD1Q9UP38 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FZD1Q9UP38 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FZD1Q9UP38 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FZD1Q9UP38 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FZD1Q9UP38 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FZD1Q9UP38 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FZD1Q9UP38 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FZD1Q9UP38 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
FZD1Q9UP38 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FZD1Q9UP38 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FZD1Q9UP38 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FZD1Q9UP38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
FZD1Q9UP38 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FZD1Q9UP38 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FZD1Q9UP38 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
FZD1Q9UP38 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
FZD1Q9UP38 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FZD1Q9UP38 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FZD1Q9UP38 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FZD1Q9UP38 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FZD1Q9UP38 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FZD1Q9UP38 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FZD1Q9UP38 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FZD1Q9UP38 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FZD1Q9UP38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FZD1Q9UP38 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FZD1Q9UP38 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FZD1Q9UP38 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FZD1Q9UP38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FZD1Q9UP38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
FZD1Q9UP38 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FZD1Q9UP38 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FZD1Q9UP38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FZD1Q9UP38 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FZD1Q9UP38 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
FZD1Q9UP38 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FZD1Q9UP38 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FZD1Q9UP38 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
FZD1Q9UP38 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FZD1Q9UP38 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms