Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BRPF3Q9ULD4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BRPF3Q9ULD4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BRPF3Q9ULD4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
BRPF3Q9ULD4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BRPF3Q9ULD4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
BRPF3Q9ULD4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
BRPF3Q9ULD4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BRPF3Q9ULD4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
BRPF3Q9ULD4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BRPF3Q9ULD4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BRPF3Q9ULD4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRPF3Q9ULD4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BRPF3Q9ULD4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BRPF3Q9ULD4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BRPF3Q9ULD4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BRPF3Q9ULD4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRPF3Q9ULD4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRPF3Q9ULD4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRPF3Q9ULD4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRPF3Q9ULD4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BRPF3Q9ULD4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
BRPF3Q9ULD4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BRPF3Q9ULD4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BRPF3Q9ULD4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
BRPF3Q9ULD4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BRPF3Q9ULD4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
BRPF3Q9ULD4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BRPF3Q9ULD4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BRPF3Q9ULD4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRPF3Q9ULD4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BRPF3Q9ULD4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
BRPF3Q9ULD4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
BRPF3Q9ULD4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRPF3Q9ULD4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRPF3Q9ULD4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
BRPF3Q9ULD4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
BRPF3Q9ULD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
BRPF3Q9ULD4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
BRPF3Q9ULD4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BRPF3Q9ULD4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
BRPF3Q9ULD4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
BRPF3Q9ULD4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
BRPF3Q9ULD4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
BRPF3Q9ULD4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
BRPF3Q9ULD4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRPF3Q9ULD4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
BRPF3Q9ULD4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BRPF3Q9ULD4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
BRPF3Q9ULD4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BRPF3Q9ULD4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
BRPF3Q9ULD4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
BRPF3Q9ULD4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BRPF3Q9ULD4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRPF3Q9ULD4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRPF3Q9ULD4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BRPF3Q9ULD4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
BRPF3Q9ULD4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRPF3Q9ULD4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRPF3Q9ULD4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BRPF3Q9ULD4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
BRPF3Q9ULD4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRPF3Q9ULD4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
BRPF3Q9ULD4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
BRPF3Q9ULD4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRPF3Q9ULD4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRPF3Q9ULD4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRPF3Q9ULD4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms