Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RCAN3Q9UKA8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RCAN3Q9UKA8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
RCAN3Q9UKA8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RCAN3Q9UKA8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RCAN3Q9UKA8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RCAN3Q9UKA8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
RCAN3Q9UKA8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RCAN3Q9UKA8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RCAN3Q9UKA8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RCAN3Q9UKA8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
RCAN3Q9UKA8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
RCAN3Q9UKA8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RCAN3Q9UKA8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RCAN3Q9UKA8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RCAN3Q9UKA8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RCAN3Q9UKA8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RCAN3Q9UKA8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RCAN3Q9UKA8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RCAN3Q9UKA8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RCAN3Q9UKA8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RCAN3Q9UKA8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RCAN3Q9UKA8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RCAN3Q9UKA8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RCAN3Q9UKA8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RCAN3Q9UKA8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RCAN3Q9UKA8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RCAN3Q9UKA8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RCAN3Q9UKA8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RCAN3Q9UKA8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RCAN3Q9UKA8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RCAN3Q9UKA8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RCAN3Q9UKA8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RCAN3Q9UKA8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RCAN3Q9UKA8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RCAN3Q9UKA8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RCAN3Q9UKA8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RCAN3Q9UKA8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RCAN3Q9UKA8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RCAN3Q9UKA8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RCAN3Q9UKA8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RCAN3Q9UKA8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RCAN3Q9UKA8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RCAN3Q9UKA8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RCAN3Q9UKA8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RCAN3Q9UKA8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
RCAN3Q9UKA8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RCAN3Q9UKA8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RCAN3Q9UKA8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RCAN3Q9UKA8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RCAN3Q9UKA8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RCAN3Q9UKA8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RCAN3Q9UKA8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RCAN3Q9UKA8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RCAN3Q9UKA8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RCAN3Q9UKA8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RCAN3Q9UKA8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RCAN3Q9UKA8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RCAN3Q9UKA8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RCAN3Q9UKA8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RCAN3Q9UKA8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RCAN3Q9UKA8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RCAN3Q9UKA8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RCAN3Q9UKA8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RCAN3Q9UKA8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RCAN3Q9UKA8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RCAN3Q9UKA8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RCAN3Q9UKA8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RCAN3Q9UKA8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RCAN3Q9UKA8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RCAN3Q9UKA8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RCAN3Q9UKA8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RCAN3Q9UKA8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RCAN3Q9UKA8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RCAN3Q9UKA8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
RCAN3Q9UKA8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RCAN3Q9UKA8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RCAN3Q9UKA8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RCAN3Q9UKA8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
RCAN3Q9UKA8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RCAN3Q9UKA8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RCAN3Q9UKA8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RCAN3Q9UKA8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RCAN3Q9UKA8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RCAN3Q9UKA8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RCAN3Q9UKA8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RCAN3Q9UKA8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RCAN3Q9UKA8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RCAN3Q9UKA8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RCAN3Q9UKA8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RCAN3Q9UKA8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RCAN3Q9UKA8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RCAN3Q9UKA8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms