Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXL4Q9UKA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXL4Q9UKA2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXL4Q9UKA2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FBXL4Q9UKA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXL4Q9UKA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXL4Q9UKA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXL4Q9UKA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXL4Q9UKA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXL4Q9UKA2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL4Q9UKA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXL4Q9UKA2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXL4Q9UKA2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL4Q9UKA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXL4Q9UKA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXL4Q9UKA2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXL4Q9UKA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXL4Q9UKA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXL4Q9UKA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXL4Q9UKA2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXL4Q9UKA2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXL4Q9UKA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXL4Q9UKA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXL4Q9UKA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXL4Q9UKA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXL4Q9UKA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXL4Q9UKA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXL4Q9UKA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXL4Q9UKA2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXL4Q9UKA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXL4Q9UKA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXL4Q9UKA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXL4Q9UKA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXL4Q9UKA2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXL4Q9UKA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXL4Q9UKA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXL4Q9UKA2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXL4Q9UKA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXL4Q9UKA2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXL4Q9UKA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXL4Q9UKA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXL4Q9UKA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXL4Q9UKA2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXL4Q9UKA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXL4Q9UKA2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXL4Q9UKA2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXL4Q9UKA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXL4Q9UKA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXL4Q9UKA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXL4Q9UKA2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXL4Q9UKA2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXL4Q9UKA2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXL4Q9UKA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXL4Q9UKA2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXL4Q9UKA2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXL4Q9UKA2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXL4Q9UKA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXL4Q9UKA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXL4Q9UKA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXL4Q9UKA2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXL4Q9UKA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXL4Q9UKA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXL4Q9UKA2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXL4Q9UKA2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXL4Q9UKA2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXL4Q9UKA2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXL4Q9UKA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXL4Q9UKA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXL4Q9UKA2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXL4Q9UKA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXL4Q9UKA2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXL4Q9UKA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXL4Q9UKA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXL4Q9UKA2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FBXL4Q9UKA2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL4Q9UKA2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL4Q9UKA2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL4Q9UKA2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXL4Q9UKA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXL4Q9UKA2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXL4Q9UKA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms