Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACFD1Q9UGQ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACFD1Q9UGQ2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACFD1Q9UGQ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACFD1Q9UGQ2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACFD1Q9UGQ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACFD1Q9UGQ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACFD1Q9UGQ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACFD1Q9UGQ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACFD1Q9UGQ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACFD1Q9UGQ2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACFD1Q9UGQ2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACFD1Q9UGQ2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACFD1Q9UGQ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACFD1Q9UGQ2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACFD1Q9UGQ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACFD1Q9UGQ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACFD1Q9UGQ2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACFD1Q9UGQ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACFD1Q9UGQ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACFD1Q9UGQ2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACFD1Q9UGQ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACFD1Q9UGQ2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACFD1Q9UGQ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACFD1Q9UGQ2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACFD1Q9UGQ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACFD1Q9UGQ2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACFD1Q9UGQ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACFD1Q9UGQ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACFD1Q9UGQ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACFD1Q9UGQ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACFD1Q9UGQ2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACFD1Q9UGQ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACFD1Q9UGQ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACFD1Q9UGQ2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACFD1Q9UGQ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACFD1Q9UGQ2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACFD1Q9UGQ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACFD1Q9UGQ2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACFD1Q9UGQ2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACFD1Q9UGQ2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACFD1Q9UGQ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CACFD1Q9UGQ2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACFD1Q9UGQ2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACFD1Q9UGQ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACFD1Q9UGQ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACFD1Q9UGQ2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACFD1Q9UGQ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACFD1Q9UGQ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACFD1Q9UGQ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACFD1Q9UGQ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACFD1Q9UGQ2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACFD1Q9UGQ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACFD1Q9UGQ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACFD1Q9UGQ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACFD1Q9UGQ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACFD1Q9UGQ2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACFD1Q9UGQ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACFD1Q9UGQ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACFD1Q9UGQ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACFD1Q9UGQ2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms