Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CGGBP1Q9UFW8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGGBP1Q9UFW8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CGGBP1Q9UFW8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGGBP1Q9UFW8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CGGBP1Q9UFW8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGGBP1Q9UFW8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGGBP1Q9UFW8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CGGBP1Q9UFW8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGGBP1Q9UFW8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGGBP1Q9UFW8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CGGBP1Q9UFW8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CGGBP1Q9UFW8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CGGBP1Q9UFW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CGGBP1Q9UFW8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGGBP1Q9UFW8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGGBP1Q9UFW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGGBP1Q9UFW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CGGBP1Q9UFW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGGBP1Q9UFW8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CGGBP1Q9UFW8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGGBP1Q9UFW8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGGBP1Q9UFW8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CGGBP1Q9UFW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGGBP1Q9UFW8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CGGBP1Q9UFW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CGGBP1Q9UFW8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGGBP1Q9UFW8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGGBP1Q9UFW8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGGBP1Q9UFW8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGGBP1Q9UFW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGGBP1Q9UFW8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGGBP1Q9UFW8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGGBP1Q9UFW8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGGBP1Q9UFW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGGBP1Q9UFW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CGGBP1Q9UFW8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CGGBP1Q9UFW8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CGGBP1Q9UFW8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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