Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA5BQ9P283 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA5BQ9P283 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA5BQ9P283 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA5BQ9P283 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SEMA5BQ9P283 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA5BQ9P283 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEMA5BQ9P283 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEMA5BQ9P283 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SEMA5BQ9P283 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEMA5BQ9P283 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA5BQ9P283 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA5BQ9P283 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA5BQ9P283 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA5BQ9P283 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA5BQ9P283 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA5BQ9P283 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA5BQ9P283 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA5BQ9P283 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA5BQ9P283 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA5BQ9P283 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA5BQ9P283 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA5BQ9P283 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA5BQ9P283 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA5BQ9P283 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA5BQ9P283 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMA5BQ9P283 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA5BQ9P283 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA5BQ9P283 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA5BQ9P283 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA5BQ9P283 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA5BQ9P283 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA5BQ9P283 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA5BQ9P283 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA5BQ9P283 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA5BQ9P283 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA5BQ9P283 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA5BQ9P283 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA5BQ9P283 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA5BQ9P283 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA5BQ9P283 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA5BQ9P283 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA5BQ9P283 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA5BQ9P283 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEMA5BQ9P283 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA5BQ9P283 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA5BQ9P283 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA5BQ9P283 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA5BQ9P283 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA5BQ9P283 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA5BQ9P283 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA5BQ9P283 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA5BQ9P283 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA5BQ9P283 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA5BQ9P283 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA5BQ9P283 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA5BQ9P283 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA5BQ9P283 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA5BQ9P283 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA5BQ9P283 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA5BQ9P283 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA5BQ9P283 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA5BQ9P283 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA5BQ9P283 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA5BQ9P283 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA5BQ9P283 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA5BQ9P283 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms