Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCKIPSDQ9NZQ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKIPSDQ9NZQ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKIPSDQ9NZQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKIPSDQ9NZQ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCKIPSDQ9NZQ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCKIPSDQ9NZQ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCKIPSDQ9NZQ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCKIPSDQ9NZQ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCKIPSDQ9NZQ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCKIPSDQ9NZQ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCKIPSDQ9NZQ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCKIPSDQ9NZQ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCKIPSDQ9NZQ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NCKIPSDQ9NZQ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NCKIPSDQ9NZQ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCKIPSDQ9NZQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCKIPSDQ9NZQ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NCKIPSDQ9NZQ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NCKIPSDQ9NZQ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NCKIPSDQ9NZQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCKIPSDQ9NZQ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCKIPSDQ9NZQ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NCKIPSDQ9NZQ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NCKIPSDQ9NZQ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCKIPSDQ9NZQ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCKIPSDQ9NZQ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCKIPSDQ9NZQ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCKIPSDQ9NZQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCKIPSDQ9NZQ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCKIPSDQ9NZQ3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCKIPSDQ9NZQ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCKIPSDQ9NZQ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCKIPSDQ9NZQ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCKIPSDQ9NZQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCKIPSDQ9NZQ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCKIPSDQ9NZQ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCKIPSDQ9NZQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCKIPSDQ9NZQ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCKIPSDQ9NZQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCKIPSDQ9NZQ3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms