Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOR4AQ9NXH8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOR4AQ9NXH8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOR4AQ9NXH8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOR4AQ9NXH8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOR4AQ9NXH8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOR4AQ9NXH8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOR4AQ9NXH8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOR4AQ9NXH8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOR4AQ9NXH8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOR4AQ9NXH8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOR4AQ9NXH8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TOR4AQ9NXH8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TOR4AQ9NXH8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TOR4AQ9NXH8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TOR4AQ9NXH8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TOR4AQ9NXH8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TOR4AQ9NXH8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TOR4AQ9NXH8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOR4AQ9NXH8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TOR4AQ9NXH8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOR4AQ9NXH8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOR4AQ9NXH8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOR4AQ9NXH8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOR4AQ9NXH8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TOR4AQ9NXH8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOR4AQ9NXH8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOR4AQ9NXH8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOR4AQ9NXH8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOR4AQ9NXH8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOR4AQ9NXH8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOR4AQ9NXH8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TOR4AQ9NXH8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOR4AQ9NXH8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOR4AQ9NXH8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOR4AQ9NXH8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOR4AQ9NXH8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOR4AQ9NXH8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOR4AQ9NXH8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOR4AQ9NXH8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOR4AQ9NXH8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOR4AQ9NXH8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOR4AQ9NXH8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOR4AQ9NXH8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOR4AQ9NXH8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOR4AQ9NXH8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOR4AQ9NXH8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOR4AQ9NXH8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOR4AQ9NXH8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOR4AQ9NXH8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOR4AQ9NXH8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOR4AQ9NXH8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOR4AQ9NXH8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOR4AQ9NXH8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOR4AQ9NXH8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOR4AQ9NXH8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOR4AQ9NXH8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TOR4AQ9NXH8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOR4AQ9NXH8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOR4AQ9NXH8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOR4AQ9NXH8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOR4AQ9NXH8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TOR4AQ9NXH8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOR4AQ9NXH8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TOR4AQ9NXH8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOR4AQ9NXH8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOR4AQ9NXH8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TOR4AQ9NXH8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOR4AQ9NXH8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TOR4AQ9NXH8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOR4AQ9NXH8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TOR4AQ9NXH8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TOR4AQ9NXH8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOR4AQ9NXH8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOR4AQ9NXH8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms