Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK13-1Q9NX77 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK13-1Q9NX77 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK13-1Q9NX77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVK13-1Q9NX77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERVK13-1Q9NX77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVK13-1Q9NX77 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVK13-1Q9NX77 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVK13-1Q9NX77 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVK13-1Q9NX77 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVK13-1Q9NX77 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVK13-1Q9NX77 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVK13-1Q9NX77 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVK13-1Q9NX77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ERVK13-1Q9NX77 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK13-1Q9NX77 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERVK13-1Q9NX77 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERVK13-1Q9NX77 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK13-1Q9NX77 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERVK13-1Q9NX77 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ERVK13-1Q9NX77 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK13-1Q9NX77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERVK13-1Q9NX77 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK13-1Q9NX77 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ERVK13-1Q9NX77 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVK13-1Q9NX77 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVK13-1Q9NX77 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK13-1Q9NX77 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERVK13-1Q9NX77 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK13-1Q9NX77 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERVK13-1Q9NX77 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERVK13-1Q9NX77 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK13-1Q9NX77 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERVK13-1Q9NX77 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ERVK13-1Q9NX77 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ERVK13-1Q9NX77 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ERVK13-1Q9NX77 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERVK13-1Q9NX77 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERVK13-1Q9NX77 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERVK13-1Q9NX77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK13-1Q9NX77 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERVK13-1Q9NX77 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERVK13-1Q9NX77 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERVK13-1Q9NX77 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVK13-1Q9NX77 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVK13-1Q9NX77 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK13-1Q9NX77 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVK13-1Q9NX77 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK13-1Q9NX77 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK13-1Q9NX77 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVK13-1Q9NX77 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERVK13-1Q9NX77 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERVK13-1Q9NX77 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK13-1Q9NX77 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK13-1Q9NX77 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK13-1Q9NX77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK13-1Q9NX77 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK13-1Q9NX77 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK13-1Q9NX77 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK13-1Q9NX77 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK13-1Q9NX77 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK13-1Q9NX77 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK13-1Q9NX77 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK13-1Q9NX77 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK13-1Q9NX77 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms