Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX18Q9NVP1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX18Q9NVP1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX18Q9NVP1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX18Q9NVP1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX18Q9NVP1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX18Q9NVP1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX18Q9NVP1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX18Q9NVP1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX18Q9NVP1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX18Q9NVP1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX18Q9NVP1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX18Q9NVP1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX18Q9NVP1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX18Q9NVP1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX18Q9NVP1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX18Q9NVP1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX18Q9NVP1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX18Q9NVP1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX18Q9NVP1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX18Q9NVP1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX18Q9NVP1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX18Q9NVP1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX18Q9NVP1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX18Q9NVP1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX18Q9NVP1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX18Q9NVP1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX18Q9NVP1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX18Q9NVP1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX18Q9NVP1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX18Q9NVP1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX18Q9NVP1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX18Q9NVP1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX18Q9NVP1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX18Q9NVP1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX18Q9NVP1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX18Q9NVP1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX18Q9NVP1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX18Q9NVP1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX18Q9NVP1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX18Q9NVP1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX18Q9NVP1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX18Q9NVP1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX18Q9NVP1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX18Q9NVP1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX18Q9NVP1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX18Q9NVP1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX18Q9NVP1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX18Q9NVP1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX18Q9NVP1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDX18Q9NVP1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX18Q9NVP1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX18Q9NVP1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDX18Q9NVP1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX18Q9NVP1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDX18Q9NVP1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDX18Q9NVP1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DDX18Q9NVP1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DDX18Q9NVP1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX18Q9NVP1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX18Q9NVP1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX18Q9NVP1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX18Q9NVP1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DDX18Q9NVP1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms