Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SEMA4GQ9NTN9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA4GQ9NTN9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA4GQ9NTN9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMA4GQ9NTN9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA4GQ9NTN9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA4GQ9NTN9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA4GQ9NTN9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SEMA4GQ9NTN9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4GQ9NTN9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4GQ9NTN9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA4GQ9NTN9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA4GQ9NTN9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMA4GQ9NTN9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SEMA4GQ9NTN9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEMA4GQ9NTN9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMA4GQ9NTN9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA4GQ9NTN9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA4GQ9NTN9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEMA4GQ9NTN9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA4GQ9NTN9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA4GQ9NTN9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4GQ9NTN9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA4GQ9NTN9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4GQ9NTN9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4GQ9NTN9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4GQ9NTN9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA4GQ9NTN9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA4GQ9NTN9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEMA4GQ9NTN9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA4GQ9NTN9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4GQ9NTN9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA4GQ9NTN9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA4GQ9NTN9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA4GQ9NTN9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEMA4GQ9NTN9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA4GQ9NTN9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA4GQ9NTN9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA4GQ9NTN9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA4GQ9NTN9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SEMA4GQ9NTN9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SEMA4GQ9NTN9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA4GQ9NTN9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEMA4GQ9NTN9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEMA4GQ9NTN9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEMA4GQ9NTN9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEMA4GQ9NTN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4GQ9NTN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEMA4GQ9NTN9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEMA4GQ9NTN9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEMA4GQ9NTN9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEMA4GQ9NTN9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA4GQ9NTN9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEMA4GQ9NTN9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEMA4GQ9NTN9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEMA4GQ9NTN9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEMA4GQ9NTN9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA4GQ9NTN9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4GQ9NTN9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA4GQ9NTN9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA4GQ9NTN9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA4GQ9NTN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA4GQ9NTN9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA4GQ9NTN9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4GQ9NTN9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA4GQ9NTN9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA4GQ9NTN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA4GQ9NTN9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA4GQ9NTN9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA4GQ9NTN9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA4GQ9NTN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA4GQ9NTN9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4GQ9NTN9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA4GQ9NTN9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA4GQ9NTN9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA4GQ9NTN9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA4GQ9NTN9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA4GQ9NTN9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA4GQ9NTN9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA4GQ9NTN9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SEMA4GQ9NTN9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA4GQ9NTN9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4GQ9NTN9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms